Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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