Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usp9yF8VPU6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp9yF8VPU6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp9yF8VPU6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp9yF8VPU6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp9yF8VPU6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms