Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms