Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8005F6YKY3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms