Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10378F6XQQ1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10378F6XQQ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10378F6XQQ1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10378F6XQQ1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10378F6XQQ1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10378F6XQQ1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10378F6XQQ1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm10378F6XQQ1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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