Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms