Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms