Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms