Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms