Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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