Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms