Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsf1E9PWW9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms