Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms