Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms