Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms