Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah3B2RWG3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms