Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rd3lB2RV38 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms