Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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