Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms