Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprbB2RU80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprbB2RU80 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms