Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms