Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms