Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms