Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms