Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16430A6X8J1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm16430A6X8J1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms