Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3173A6NAS3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms