Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbp4A4UUI3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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