Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms