Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms