Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SetxA2AKX3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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