Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms