Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms