Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms