Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Prdm16A2A935 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Prdm16A2A935 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Prdm16A2A935 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Prdm16A2A935 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm16A2A935 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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