Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc27A2A6Q5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms