Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms