Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A0A0U1RNP2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RNP2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms