Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms