Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms