Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gria3Q9Z2W9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms