Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms