Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms