Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms