Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms