Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms