Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdpk1Q9Z2A0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms