Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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