Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxankQ9Z205 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms