Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uso1Q9Z1Z0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms