Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms